Faz parte do processo operacional do aterro sanitário uma estação de tratamento para efluentes líquidos.
A estação é composta por filtros biológicos, uma lagoa aerada, lagoas facultativas, além de dois banhados em uma área de 10 mil m² os quais utilizam plantas emergentes como junco e taboão no processo de tratamento do lixiviado - líquido resultante da dissolução de várias substâncias poluentes dos resíduos.